アフリカ

自然 (2023)この記事を引用

273 オルトメトリック

メトリクスの詳細

HIV-1 は依然として世界的な健康危機であり 1、新たな治療標的を特定する必要性が浮き彫りになっています。 今回、アフリカにおける不均衡な HIV-1 負荷と顕著なヒトゲノム多様性を考慮して 2、我々は、アフリカのゲノム解析のための国際協力に参加している HIV-1 とともに生きるアフリカ系 3,879 人を対象に、設定値のウイルス量制御の遺伝的決定要因を評価した。 HIV3。 我々は、染色体 1 上のこれまでに記載されていない関連シグナルを特定しました。このシグナルでは、ピーク変異体が、マイナー対立遺伝子コピーあたり 1 ml あたり約 0.3 log10 変換コピーの低い設定値ウイルス量と関連しており、アフリカ系の集団に特異的です。 一番上の関連変異体は遺伝子間であり、長い遺伝子間の非コード RNA (LINC00624) と、DNA 修復に関与するヘリカーゼをコードするコード遺伝子 CHD1L の間に位置します 4。 iPS 細胞由来のマクロファージおよび他の不死化細胞株における感染アッセイでは、CHD1L ノックダウン細胞および CHD1L ノックアウト細胞における HIV-1 複製の増加が示されました。 我々は集団遺伝学的研究から、CHD1L付近のアフリカ特有の遺伝的変異が生体内でのHIV複製と関連しているという証拠を提供する。 実験研究では、CHD1L が in vitro で一部の細胞型における HIV 感染を制限できることが示唆されていますが、我々の細胞ベースのアッセイでは不可能な、in vivo での HIV 拡散に対する CHD1L の潜在的な間接的な影響を含め、我々の観察の根底にあるメカニズムを理解するにはさらなる研究が必要です。要約します。

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個人レベルのジェノタイピングデータへのアクセスは、ICGH 協力協定に署名することで HIV ゲノミクス国際協力 (ICGH) に参加している機関の研究者に限定されています。ICGH 協力協定は、要求に応じて入手可能です ([email protected])。 研究参加者全員の HIV 診断は非常に機密性が高いため、治験審査委員会は、潜在的な再識別に関連するリスクが非常に高いと判断し、個人レベルのデータの広範な共有を妨げています。 GWAS の概要統計は、ヒトゲノム全体の関連研究の NHGRI-EBI カタログ (https://www.ebi.ac.uk/gwas/home) に受託番号 GCST90269914 で寄託されています。 RNA-seq データは NCBI (PRJEB18581) で入手でき、eQTL の結果は GitHub (https://github.com/smontgomlab/AFGR) で入手できます。

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